Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIRAP54198 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIRAP54198 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIRAP54198 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIRAP54198 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIRAP54198 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIRAP54198 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIRAP54198 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIRAP54198 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIRAP54198 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIRAP54198 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIRAP54198 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIRAP54198 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIRAP54198 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HIRAP54198 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIRAP54198 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIRAP54198 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIRAP54198 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIRAP54198 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIRAP54198 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIRAP54198 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIRAP54198 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIRAP54198 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRAP54198 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRAP54198 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRAP54198 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRAP54198 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRAP54198 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRAP54198 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRAP54198 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms