Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms