Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLK1P49759 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLK1P49759 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms