Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRP9P49458 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRP9P49458 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRP9P49458 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRP9P49458 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRP9P49458 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRP9P49458 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRP9P49458 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRP9P49458 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRP9P49458 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRP9P49458 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRP9P49458 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms