Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCLCP48506 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCLCP48506 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCLCP48506 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GCLCP48506 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCLCP48506 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GCLCP48506 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCLCP48506 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCLCP48506 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GCLCP48506 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms