Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms