Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME1P48163 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME1P48163 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME1P48163 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME1P48163 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME1P48163 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME1P48163 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME1P48163 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME1P48163 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME1P48163 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME1P48163 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME1P48163 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME1P48163 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME1P48163 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME1P48163 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME1P48163 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME1P48163 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME1P48163 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME1P48163 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME1P48163 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME1P48163 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME1P48163 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME1P48163 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms