Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MDH1P40925 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDH1P40925 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDH1P40925 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDH1P40925 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDH1P40925 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MDH1P40925 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MDH1P40925 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDH1P40925 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDH1P40925 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDH1P40925 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDH1P40925 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDH1P40925 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDH1P40925 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDH1P40925 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDH1P40925 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDH1P40925 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDH1P40925 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MDH1P40925 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDH1P40925 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDH1P40925 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDH1P40925 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDH1P40925 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDH1P40925 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDH1P40925 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDH1P40925 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDH1P40925 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDH1P40925 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDH1P40925 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDH1P40925 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDH1P40925 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDH1P40925 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDH1P40925 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDH1P40925 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MDH1P40925 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDH1P40925 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDH1P40925 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDH1P40925 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDH1P40925 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MDH1P40925 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDH1P40925 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MDH1P40925 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDH1P40925 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDH1P40925 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDH1P40925 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDH1P40925 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDH1P40925 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms