Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC26A3P40879 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms