Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBRP36941 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBRP36941 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBRP36941 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms