Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms