Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms