Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms