Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms