Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ECHS1P30084 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECHS1P30084 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms