Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTSSP25774 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTSSP25774 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CTSSP25774 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTSSP25774 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms