Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA1P25391 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms