Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B4P23634 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms