Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms