Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms