Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms