Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRF1P14222 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRF1P14222 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRF1P14222 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRF1P14222 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRF1P14222 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRF1P14222 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRF1P14222 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRF1P14222 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRF1P14222 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRF1P14222 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms