Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL2P13500 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL2P13500 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL2P13500 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms