Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH1P12830 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH1P12830 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH1P12830 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDH1P12830 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDH1P12830 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDH1P12830 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDH1P12830 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDH1P12830 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms