Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RLBP1P12271 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms