Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMC1P11047 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms