Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI3P10071 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI3P10071 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLI3P10071 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLI3P10071 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLI3P10071 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLI3P10071 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLI3P10071 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLI3P10071 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GLI3P10071 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GLI3P10071 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GLI3P10071 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GLI3P10071 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GLI3P10071 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GLI3P10071 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GLI3P10071 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GLI3P10071 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GLI3P10071 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GLI3P10071 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GLI3P10071 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI3P10071 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI3P10071 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI3P10071 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI3P10071 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI3P10071 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI3P10071 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI3P10071 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI3P10071 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI3P10071 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI3P10071 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI3P10071 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI3P10071 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI3P10071 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI3P10071 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI3P10071 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI3P10071 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI3P10071 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI3P10071 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI3P10071 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI3P10071 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI3P10071 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI3P10071 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI3P10071 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI3P10071 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI3P10071 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI3P10071 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI3P10071 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI3P10071 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI3P10071 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI3P10071 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI3P10071 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI3P10071 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI3P10071 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI3P10071 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI3P10071 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI3P10071 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI3P10071 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI3P10071 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI3P10071 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI3P10071 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI3P10071 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI3P10071 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI3P10071 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI3P10071 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI3P10071 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI3P10071 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI3P10071 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI3P10071 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI3P10071 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI3P10071 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms