Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms