Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSF1RP07333 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms