Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MYCNP04198 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MYCNP04198 AC063950.1-202ENST00000600133 568 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MYCNP04198 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MYCNP04198 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MYCNP04198 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYCNP04198 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MYCNP04198 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYCNP04198 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYCNP04198 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MYCNP04198 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MYCNP04198 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYCNP04198 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MYCNP04198 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYCNP04198 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MYCNP04198 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYCNP04198 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCNP04198 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MYCNP04198 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYCNP04198 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYCNP04198 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYCNP04198 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYCNP04198 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYCNP04198 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYCNP04198 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYCNP04198 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms