Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGAP02671 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGAP02671 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGAP02671 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGAP02671 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGAP02671 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGAP02671 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGAP02671 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGAP02671 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGAP02671 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGAP02671 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGAP02671 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGAP02671 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGAP02671 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGAP02671 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGAP02671 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGAP02671 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGAP02671 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGAP02671 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGAP02671 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGAP02671 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGAP02671 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FGAP02671 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGAP02671 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGAP02671 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms