Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC3P02656 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC3P02656 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC3P02656 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC3P02656 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC3P02656 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC3P02656 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC3P02656 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC3P02656 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC3P02656 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOC3P02656 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOC3P02656 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOC3P02656 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOC3P02656 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOC3P02656 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOC3P02656 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOC3P02656 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOC3P02656 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms