Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf47O95873 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms