Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms