Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD4O95243 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD4O95243 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD4O95243 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD4O95243 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD4O95243 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD4O95243 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD4O95243 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD4O95243 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD4O95243 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD4O95243 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD4O95243 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD4O95243 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD4O95243 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD4O95243 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD4O95243 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD4O95243 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD4O95243 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD4O95243 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD4O95243 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD4O95243 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD4O95243 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD4O95243 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD4O95243 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD4O95243 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD4O95243 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD4O95243 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD4O95243 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD4O95243 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD4O95243 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms