Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms