Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSO75390 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSO75390 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSO75390 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSO75390 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSO75390 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSO75390 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSO75390 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSO75390 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSO75390 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSO75390 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSO75390 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSO75390 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSO75390 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSO75390 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSO75390 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSO75390 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSO75390 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSO75390 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSO75390 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSO75390 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSO75390 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSO75390 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSO75390 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSO75390 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSO75390 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSO75390 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSO75390 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSO75390 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSO75390 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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