Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD2O60548 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms