Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms