Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms