Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms