Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM6BO15054 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM6BO15054 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms