Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMBP2O15034 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms