Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms