Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms