Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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