Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP5LA4QPB2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms