Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB19A4D1S5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms