Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC144AA2RUR9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms