Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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